Resultados

El programa ÓMICAS se ha trazado como resultados la generación de conocimiento teórico y aplicado distribuido de la siguiente manera:

Generación de conocimiento

Artículos

Publicados

Año	Artículo
2020	J. M. Marmolejo-Tejada and A. Jaramillo-Botero. Effect of surface oxidation on the electronic transport properties of phosphorene gas sensors: a computational study. The Royal Society of Chemistry, DOI: 10.1039/d0ra00416b
2019	J. M. Marmolejo-Tejada and A. Jaramillo-Botero. Partially-oxidized phosphorene sensor for the detection of sub-nano Molar concentrations of nitric oxide: A first-principles study. Physical Chemistry Chemical Physics. DOI 10.1039/C9CP03912K
2019	Devia CA; Rojas JP; Petro E; Martinez C; Mondragon IF; Patino D; Rebolledo MC; Colorado J. High-Throughput Biomass Estimation in Rice Crops Using UAV Multispectral Imagery. Journal of Intelligent & Robotic Systems, DOI 10.1007/s10846-019-01001-5
2019	Jaramillo-Botero A; Marmolejo-Tejada JM. All-Armchar Graphene Nanoriboon Field Uriding Phosphate Glucose Sensor: First-Principles In-Silico Design and Characterization. En IEEE Sensors, DOI 10.1109/JSEN.2019.2896448

Sometidos

Año	Artículo
2020	Al-driven nitrogen estimation in rice crops from UAV-captured images
2019	Nonlinear model predictive control for input-affine systems using the extended modal series method
2019	An air-ground WSN-UAV approach for crop monitoring
2019	“Recent Progress in Nanotechnology for IoT Applications” sometido al Journal of Net and Computer Applications (Elsevier, Q1)

En preparación

Año	Artículo
2019	Epigenetic mechanisms involved in aluminum stress response in plants
2019	Electrochemical Bio-Nanosensor: A Review of Recent Applications” a ECS
2019	Role of G-Protein-coupled Receptor 1, GCR1, as a true GPCR in Plant Hormone Perception and Action
2019	AI-driven nitrogen estimation in rice crops using aerial robotic systems

Capítulos de libros

Productos patentados

Año	Título invención	Autores
2020	Phenoagro: sistema y método para el fenotipado de plantas mediante IoT	María Camila Rebolledo, Juan Andrés Cardoso, Andrés Jaramillo, Hernán Dario Benitez, Luis Eduardo Tobón
2019	Synthesis of functionalised gold nanoparticles and nanocompounds containing same for measuring sucrose or starch in cells	Andrés Jaramillo-Botero, Diana Patricia Hermith Ramírez y Pedro Hernández
2019	Equipo medidor fotoacústico portátil de razón de evolución de oxígeno	Fernando Gordillo, Jhon Alexander García, Diego Fernando Valencia

Apropiación social

Eventos científicos

Año	Conferencia	Ponente	Ponencia y Autores
2019	Complex Networks 2019	Miguel Romero	Romero, M; Finke, J; Quimbaya, M; Rocha, C; In-silico gen annotation prediction using the co-expression network structure. Lisbon, Portugal
2019	16th International Conference on Informatics in Control, Automation and Robotics	Julián Colorado	Devia, C.; Rojas, J.; Petro, E.; Martinez, C.; Mondragon, I.; Patino, D.; Rebolledo, C. and Colorado, J. (2019). Aerial Monitoring of Rice Crop Variables using an UAV Robotic System. In Proceedings of the 16th International Conference on Informatics in Control, Automation and Robotics - Volume 2: ICINCO, 29-31 July. Prague, Czech Republic, ISBN 978-989-758-380-3, pages 97-103. DOI:10.5220/0007909900970103 https://www.scitepress.org/PublicationsDetail.aspx?ID=z7YDJoVCoNc=&t=1
2019	The 6th International Conference on Control, Decision and Information Technologies (CODIT’19)	Julián Colorado	Gradient-Descent based Nonlinear Model Predictive Control for Input-Affine Systems. The 6th International Conference on Control, Decision and Information Technologies (CODIT’19). April 23-26, 2019. Paris, France.

Talleres y seminarios

Año	Actividad	Lugar	Nivel	Nombre de la actividad académica
2019	Taller	PUJC	Pregrado y posgrado	Uso de herramientas puntuales de genómica comparativa
2019	Taller	PUJC	Pregrado y posgrado	Diseño de nanosensores para cultivos agrícolas
2019	Taller	PUJC	Pregrado y posgrado	Modelado y simulación de proteínas mediante dinámica molecular
2019	Taller	PUJC	Pregrado y posgrado	Tecnologías y métodos para la fenotipificación de cultivos agrícolas
2019	Taller	PUJC	Pregrado y posgrado	Aprendizaje automático en bioinformática
2019	Taller	PUJC	Pregrado y posgrado	Mitigación de gases de efecto invernadero en sistemas de cultivos: teoría y cuantificación
2019	Seminario	PUJC	Maestría/Doctorado	Aplicación de diferentes métricas de dependencia entre variables en la detección de coexpresión de genes en el arroz, por Nicolás López
2019	Seminario	PUJC	Maestría/Doctorado	Identificación de regiones diferencialmente metiladas utilizando un modelo oculto de Markov (HMM-DM), por Jenny Gallo
2019	Seminario	PUJC	Maestría/Doctorado	WGCNA y método LASSO en la identificación de genes clave para fenotipos relacionados con la tolerancia a salinidad en plantas de arroz (Oryza Sativa), por Camila Riccio
2019	Seminario	PUJC	Maestría/Doctorado	Selección genómica mediante modelos paramétricos: Regresión de Rigde y Lasso Bayesiano, por Carolina Saavedra
2019	Seminario	PUJC	Maestría/Doctorado	Graph based data fusion: Application to Change detection and rice crops phenotyping, por David Jiménez
2019	Seminario	PUJC	Maestría/Doctorado	Node label and link prediction in complex networks, por Miguel Romero
2019	Seminario	PUJC	Maestría/Doctorado	A New Role for G-Protein-coupled Receptor 1, GCR1, as a true GPCR, por Pedro Hernández
2019	Curso	PUJC	Maestría/Doctorado	Bioinformática
2019	Curso	PUJC	Maestría/Doctorado	Nanoelectrónica

Cursos posgrado

Año/período	Nombre del curso de posgrado	Institución
2019-02	Fundamentos en algoritmos y programación	PUJC
2019-02	Genómica y proteómica	PUJC
2019-01	Procesamiento digital de imágenes	PUJC
2019-01	Diseño e implementación de algoritmos	PUJC

Cursos de capacitaciones

Año/período	Curso	Institución
2019-02	Mapeo genético avanzado	Icesi
2019-02	CRISPR para la edición de genomas	Icesi

Formación

Estudiantes de doctorado

Camila Riccio
Carolina Saavedra Díaz
Chrystian Camilo Sosa
David Alejandro Jiménez
Gustavo Lara-Cruz
Hugo Jaimes Quiñones
Jenny Gallo
Manuel Camilo Valencia
Miguel Romero
Nicolás López
Pedro Miguel Hernández
Sammy Alejandro Perdomo
Sandra Loaiza

Estudiantes de maestría

Dehyro Méndez
Jairo Arcos
Juliana Chaura
Manuel Felipe García

Estudiantes de pregrado

Año/período	Nombre del curso/semillero/trabajo de grado	Institución	No. de estudiantes
2020	Trabajo de grado: Técnicas de aprendizaje de máquina aplicadas en estimación de niveles de nitrógeno en cultivos de arroz, por Juan Sebastián Caldas y Natalia Cera	PUJB	2
2020	Trabajo de grado: Optimización de trayectorias para un UAV en agricultura de precisión, por Christian Santiago Muñoz y Juan Sebastián Corredor	PUJB	2
2020	Trabajo de grado: Estimación de estrés hídrico en cultivos de arroz a partir del procesamiento de imágenes térmicas, por Daniel Pache	PUJB	1
2020	Trabajo de grado: Evaluación de la tasa de crecimiento y actividad fotosintética de variedades de arroz (Oryza Sativa) con alto potencial de rendimiento y adaptabilidad, por Andrés Felipe Arango	Uniquindío	1
2020	Trabajo de grado: Análisis de la respuesta fotoluminiscente de diferentes clases comerciales de arroz, por Juan Felipe Franco Escobar	Uniquindío	1
2020	Trabajo de grado: In-silico design of a graphene nanoribbon field effect transitor (GNRFET) sensor for the detection of starch, por Isabella López Cifuentes	PJUC	1
2019	Joven investigador: Daniel Iván Rey	Uniquindío	1
2019-02	Semillero de investigación en fisiología vegetal y ómicas aplicadas al mejoramiento vegetal	Icesi	10
2019-01	Semillero de investigación en exobiología y tópicos en ciencias planetarias	Icesi	8
2019-01	Trabajo de grado: Estimación de estrés hídrico en cultivos de arroz a a partir del procesamiento de imágenes térmicas	PUJB	1
2019-01	Semillero de Investigación en fisiología vegetal y ómicas aplicadas al mejoramiento vegetal	Icesi	10
2019-01	Curso en Bioinformática	PUJC	15
2018-02	Semillero de Investigación en fisiología vegetal y ómicas aplicadas al mejoramiento vegetal		8
2018-02	Semillero en exobiología y tópicos en ciencias planetarias	Icesi	8
2018-02	Trabajo de grado: Técnicas de aprendizaje de máquina aplicadas en estimación de niveles de nitrógeno en cultivos de arroz	PUJB	2

Desarrollo tecnológico

Productos empresariales

Productos tecnológicos

Otros