Resultados

El programa ÓMICAS se ha trazado como resultados la generación de conocimiento teórico y aplicado distribuido de la siguiente manera: 

Generación de conocimiento

Artículos

Publicados 

Año Artículo
2020 J. M. Marmolejo-Tejada and A. Jaramillo-Botero. Effect of surface oxidation on the electronic transport
properties of phosphorene gas sensors: a computational study. The Royal Society of Chemistry,
DOI: 10.1039/d0ra00416b
2019 J. M. Marmolejo-Tejada and A. Jaramillo-Botero. Partially-oxidized phosphorene sensor for the detection of
sub-nano Molar concentrations of nitric oxide: A first-principles study. Physical Chemistry Chemical Physics. 
DOI 10.1039/C9CP03912K
2019 Devia CA; Rojas JP; Petro E; Martinez C; Mondragon IF; Patino D; Rebolledo MC; Colorado J. High-Throughput
Biomass Estimation in Rice Crops Using UAV Multispectral Imagery. Journal of Intelligent & Robotic Systems, 
DOI 10.1007/s10846-019-01001-5
2019

Jaramillo-Botero A; Marmolejo-Tejada JM. All-Armchar Graphene Nanoriboon Field Uriding Phosphate Glucose
Sensor: First-Principles In-Silico Design and Characterization. En IEEE Sensors, DOI 10.1109/JSEN.2019.2896448

 

Sometidos

Año Artículo
2020 AI-driven maturity stage identification of Amazonian fruits
2020 A novel NIR-image segmentation method for the precise estimation of above-ground biomass in rice crops
2020 Al-driven nitrogen estimation in rice crops from UAV-captured images 
2019 Nonlinear model predictive control for input-affine systems using the extended modal series method 
2019 An air-ground WSN-UAV approach for crop monitoring
2019 “Recent Progress in Nanotechnology for IoT Applications” sometido al Journal of Net and Computer
Applications (Elsevier, Q1)

 

En preparación

Año Artículo
2019 Epigenetic mechanisms involved in aluminum stress response in plants
2019 Electrochemical Bio-Nanosensor: A Review of Recent Applications” a ECS 
2019 Role of G-Protein-coupled Receptor 1, GCR1, as a true GPCR in Plant Hormone Perception and Action
2019 AI-driven nitrogen estimation in rice crops using aerial robotic systems

Capítulos de libros

Productos patentados

Año Título invención Autores
2020 Phenoagro: sistema y método para el fenotipado de plantas mediante
IoT		 María Camila Rebolledo, Juan Andrés Cardoso,
Andrés Jaramillo, Hernán Dario Benitez, Luis
Eduardo Tobón
2019 Synthesis of functionalised gold nanoparticles and nanocompounds
containing same for measuring sucrose or starch in cells		 Andrés Jaramillo-Botero, Diana Patricia 
Hermith Ramírez y Pedro Hernández 
2019 Equipo medidor fotoacústico portátil de razón de evolución de oxígeno Fernando Gordillo, Jhon Alexander García,
Diego Fernando Valencia

Apropiación social

Eventos científicos

Año Conferencia Ponente Ponencia y Autores 
2020 SPIE Optics+Photonics 2020 Julián Colorado Manuel G. Forero, Dehyro Méndez, Harold F. Murcía. 2020. Comparative study of point cloud registration techniques between ICP and others. In Proceedings of the SPIE Optics+Photonics 2020, 24 - 28 August, San Diego, CA, USA. https://spie.org/OPO/conferencedetails/digital-image-processing#session-10
2019 Complex Networks 2019 Miguel Romero Romero, M; Finke, J; Quimbaya, M; Rocha, C; In-silico gen annotation prediction using the co-expression network structure. Lisbon, Portugal
2019 16th International Conference on
Informatics in Control, Automation
and Robotics 		 Julián Colorado

Devia, C.; Rojas, J.; Petro, E.; Martinez, C.; Mondragon, I.; Patino, D.; Rebolledo, C. and Colorado, J. (2019). Aerial Monitoring of Rice Crop Variables using an UAV Robotic System. In Proceedings of the 16th International Conference on Informatics in Control, Automation and Robotics - Volume 2: ICINCO, 29-31 July. Prague, Czech Republic, ISBN 978-989-758-380-3, pages 97-103. DOI:10.5220/0007909900970103 https://www.scitepress.org/PublicationsDetail.aspx?ID=z7YDJoVCoNc=&t=1  
2019 The 6th International Conference
on Control, Decision and
Information Technologies
(CODIT’19) 		 Julián Colorado Gradient-Descent based Nonlinear Model Predictive Control for Input-Affine Systems. The 6th International Conference on Control, Decision and Information Technologies (CODIT’19). April 23-26, 2019. Paris, France.

 

Talleres y seminarios

Año Actividad Lugar Nivel Nombre de la actividad académica
2019 Taller PUJC Pregrado y posgrado Uso de herramientas puntuales de genómica comparativa
2019 Taller PUJC Pregrado y posgrado Diseño de nanosensores para cultivos agrícolas
2019 Taller PUJC Pregrado y posgrado Modelado y simulación de proteínas mediante dinámica molecular
2019 Taller PUJC Pregrado y posgrado Tecnologías y métodos para la fenotipificación de cultivos agrícolas
2019 Taller PUJC Pregrado y posgrado Aprendizaje automático en bioinformática
2019 Taller PUJC Pregrado y posgrado Mitigación de gases de efecto invernadero en sistemas de cultivos: teoría y cuantificación
2019 Seminario PUJC Maestría/Doctorado Aplicación de diferentes métricas de dependencia entre variables en la detección de coexpresión de
genes en el arroz, por Nicolás López
2019 Seminario PUJC Maestría/Doctorado Identificación de regiones diferencialmente metiladas utilizando un modelo oculto de Markov (HMM-DM),
por Jenny Gallo
2019 Seminario PUJC Maestría/Doctorado WGCNA y método LASSO en la identificación de genes clave para fenotipos relacionados con la tolerancia
a salinidad en plantas de arroz (Oryza Sativa), por Camila Riccio 
2019 Seminario PUJC Maestría/Doctorado Selección genómica mediante modelos paramétricos: Regresión de Rigde y Lasso Bayesiano,
por Carolina Saavedra
2019 Seminario PUJC Maestría/Doctorado Graph based data fusion: Application to Change detection and rice crops phenotyping, por David Jiménez
2019 Seminario PUJC Maestría/Doctorado Node label and link prediction in complex networks, por Miguel Romero
2019 Seminario PUJC Maestría/Doctorado A New Role for G-Protein-coupled Receptor 1, GCR1, as a true GPCR, por Pedro Hernández
2019 Curso PUJC Maestría/Doctorado Bioinformática
2019 Curso PUJC Maestría/Doctorado Nanoelectrónica

Cursos posgrado

Año/período Nombre del curso de posgrado Institución
2019-02 Fundamentos en algoritmos y programación PUJC
2019-02 Genómica y proteómica PUJC
2019-01 Procesamiento digital de imágenes PUJC
2019-01 Diseño e implementación de algoritmos PUJC

Cursos de capacitaciones

Año/período Curso Institución
2019-02 Mapeo genético avanzado  Icesi
2019-02 CRISPR para la edición de genomas Icesi

Formación

Estudiantes de doctorado

Camila Riccio
Carolina Saavedra Díaz
Chrystian Camilo Sosa
David Alejandro Jiménez
Gustavo Lara-Cruz
Hugo Jaimes Quiñones
Jenny Gallo
Manuel Camilo Valencia
Miguel Romero
Nicolás López
Pedro Miguel Hernández
Sammy Alejandro Perdomo

Estudiantes de maestría

Damián Martínez
Dehyro Méndez
Jairo Arcos
Juliana Chaura
Manuel Felipe García

Estudiantes de pregrado

Año/período Nombre del curso/semillero/trabajo de grado Institución No. de
estudiantes 		 Proyecto
2020 Trabajo de grado: Control de altura basado en información visual y láser
para monitoreo de cultivos agrícolas mediante un UAV, por Wilson
Andrés Benavides Castro y Juan Camilo Tolosa Medina		 PUJB 2 P4
2020 Trabajo de grado: Mediciones de REO con FA en arroz y nanopartícula
de TiO2, por Felipe Casas		 Uniquindío 1 P4
2020 Trabajo de grado: Caracterización de un canal inalámbrico en un cultivo
de arroz, por Juan Zambrano 		 PUJC 1 P4
2020 Trabajo de grado: Sistema de monitoreo fenotípico de Arabidopsis
Thaliana,activación de la fotosíntesis y ciclos foto morfogénicos en
espacios sin luz natural, por Julián Llamo		 PUJC  1 P4
2020 Trabajo de grado: Técnicas de aprendizaje de máquina aplicadas en
estimación de niveles de nitrógeno en cultivos de arroz, por Juan
Sebastián Caldas y Natalia Cera		 PUJB 2 P4
2020 Trabajo de grado: Optimización de trayectorias para un UAV en
agricultura de precisión, por Christian Santiago Muñoz y
Juan Sebastián Corredor		 PUJB 2 P4
2020 Trabajo de grado: Evaluación de la tasa de crecimiento y actividad
fotosintética de variedades de arroz (Oryza Sativa) con alto
potencial de rendimiento y adaptabilidad, por Andrés Felipe Arango		 Uniquindío 1 P4
2020 Trabajo de grado: Análisis de la respuesta fotoluminiscente de
diferentes clases comerciales de arroz, por Juan Felipe
Franco Escobar		 Uniquindío 1 P4
2020 Trabajo de grado: In-silico design of a graphene nanoribbon field
effect transitor (GNRFET) sensor for the detection of starch, por 
Isabella López Cifuentes  		 PJUC 1 P2
2019-02 Trabajo de grado: Estimación de estrés hídrico en cultivos de arroz a
partir del procesamiento de imágenes térmicas, por Daniel Panche 		 PUJB 1 P4
2019-02 Trabajo de grado: Segmentación del dosel arboreo en cultivos de arroz
a partir de procesamiento de imágenes, por David Felipe Cuellar 		 PUJB 1 P4
2018-02 Trabajo de grado: Técnicas de aprendizaje de máquina aplicadas en 
estimación de niveles de nitrógeno en cultivos de arroz, por Juan
Sebastián Caldas y Natalia Cera Bornacelli 		 PUJB 2 P4

 

Vinculación de recurso humano

Estudiantes de pregrado

Año/período Nombre del curso/semillero/trabajo de grado Institución No. de
estudiantes 		 Proyecto
2019 Joven investigador: Mariana Botero - Trabajo: NPs de Ag para atacar
el mal de Panamá		 Uniquindío 1 P4
2019 Joven investigador: Daniel Iván Rey - Trabajo: Implementación de
sistema portátil para medición de REO con FA con Raspberry		 Uniquindío 1 P4
2019-02 Semillero de investigación en fisiología vegetal y ómicas aplicadas
al mejoramiento vegetal		 Icesi 10 P3
2019-01 Semillero de investigación en exobiología y tópicos en ciencias
planetarias		 Icesi 8 P3
2019-01 Semillero de Investigación en fisiología vegetal y ómicas aplicadas
al mejoramiento vegetal		 Icesi 10 P3
2019-01 Curso en Bioinformática PUJC 15 P1
2018-02 Semillero de Investigación en fisiología vegetal y ómicas aplicadas
al mejoramiento vegetal		   8 P3
2018-02 Semillero en exobiología y tópicos en ciencias planetarias  Icesi 8 P3

 

Estudiantes de maestría

Año/período Nombre del curso/semillero/trabajo de grado Institución Proyecto
2020 Héctor Enrique Heredia PUJB P4
2020 Claudia Ocampo Icesi P3

Estudiantes de doctorado

Edgar Gutiérrez
Sandra Loaiza
 

Desarrollo tecnológico

Productos empresariales

Productos tecnológicos

Otros