El programa ÓMICAS se ha trazado como resultados la generación de conocimiento teórico y aplicado distribuido de la siguiente manera:
Resultados
Generación de conocimiento
Artículos
Publicados
Año | Artículo |
2020 | Gordillo-Delgado F, Zuluaga-Acosta J, Restrepo-Guerrero G (2020) Effect of the suspension of Ag-incorporated TiO2 nanoparticles (Ag-TiO2 NPs) on certain growth, physiology and phytotoxicity parameters in spinach seedlings. PLoS ONE 15(12): e0244511. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0244511 |
2020 | Gordillo-Delgado F; Zuluaga-Acosta J; Restrepo-Guerrero G. Assessment of the development of spinach plants (Spinacia oleracea) treated with silver-incorporated titanium dioxide nanoparticles. PlosOne |
2020 | Quimbaya M; Gallo J; Sosa C; Ghneim, T 2020. Epigenetic control of plant response to heavy metal stress: A new window to explain aluminum tolerance. Frontiers in Plant Science. DOI 10.3389/fpls.2020.602625 |
2020 | Colorado, JD; Cera-Bornacelli, N; Caldas, JS; Petro, E; Rebolledo, MC; Cuellar, D; Calderon, F; Mondragon IF; Jaramillo-Botero A. Estimation of Nitrogen in Rice Crops From UAV-Captured Images. Remote Sensing 12(20): 3396. https://doi.org/10.3390/rs12203396 |
2020 | Colorado, JD; Calderón, F; Méndez, D; Petro, E; Rojas, JP; Correa, ES; Mondragón, IF; Rebolledo, MC; Jaramillo-Botero. A novel NIR-image segmentation method for the precise estimation of above-ground biomass in rice crops. PLoS ONE 15(10): e0239591. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0239591 |
2020 | Forero, M; Méndez, D; Murcía, HF. 2020. Comparative study of point cloud registration techniques between ICP and others. In Proceedings of the SPIE Optical Engineering + Applications 2020. Proceedings Volume 11510, Applications of Digital Image Processing XLIII; 115101H (2020) https://doi.org/10.1117/12.2566889 |
2020 | Jimenez DA; Benitiez HD; Vargas HD; Chanussot J. Graph-based data fusion applied to: change detection and biomass estimation in rice crops. Remote Sensing. DOI 10.3390/rs12172683 |
2020 | J. M. Marmolejo-Tejada and A. Jaramillo-Botero. Effect of surface oxidation on the electronic transport properties of phosphorene gas sensors: a computational study. The Royal Society of Chemistry, DOI: 10.1039/d0ra00416b |
2019 | J. M. Marmolejo-Tejada and A. Jaramillo-Botero. Partially-oxidized phosphorene sensor for the detection of sub-nano Molar concentrations of nitric oxide: A first-principles study. Physical Chemistry Chemical Physics. DOI 10.1039/C9CP03912K |
2019 | Devia CA; Rojas JP; Petro E; Martinez C; Mondragon IF; Patino D; Rebolledo MC; Colorado J. High-Throughput Biomass Estimation in Rice Crops Using UAV Multispectral Imagery. Journal of Intelligent & Robotic Systems, DOI 10.1007/s10846-019-01001-5 |
2019 | Jaramillo-Botero A; Marmolejo-Tejada JM. All-Armchair Graphene Nanoriboon Field Uriding Phosphate Glucose Sensor: First-Principles In-Silico Design and Characterization. En IEEE Sensors, DOI 10.1109/JSEN.2019.2896448 |
Sometidos
Año | Artículo |
2020 | Riccio C; Finke J; Rocha C. Identifying Stress Responsive Genes Using Overlapping Communities. |
En preparación
Año | Artículo |
2020 | Analyses of the proteome composition in plant |
2020 | Conservation of functional networks related whit fundamental processes in plants and humans |
2020 | Genómica comparativa entre Arabidiopsis y arroz en relación a rendimiento |
2020 | Electrochemical Bio-Nanosensor: A Review of Recent Applications |
2020 | Hall bar effect graphene device for biosensing |
2020 | Role of G-Protein-coupled Receptor 1, GCR1, as a true GPCR in Plant Hormone Perception and Action |
2020 | Prediction of Protein-Protein Interactions on the Human and Rice Interactomes |
2020 | Anotación de genes |
2020 | Emission of nitrous oxide (N2O) in soil cultivated with cane (Saccharum Officinarum): systematic literature review |
Capítulos de libros
Publicados
Año | Artículo |
2020 | Marin-Rodriguez, W; Mondragon I; Colorado J. Computer Vision for the Recognition of Fruit Maturity in Amazonian Palms Using an UAV. In book, Advances in Automation and Robotics Research, Lecture Notes in Networks and Systems, DOI. 10.1007/978-3-030-40309-6 ISBN 978-3-030-40308-9, Springer. |
Productos patentados
Aprobadas
Año | Título invención | Autores |
2020 | Síntesis de nanopartículas de oro funcionalizadas y nanocompuestos que las contiene para la medición de sacarosa o almidón en células |
Andrés Jaramillo-Botero, Diana Patricia Hermith Ramírez y Pedro Hernández |
2020 | Equipo medidor fotoacústico portátil de razón de evolución de oxígeno | Fernando Gordillo, Jhon Alexander García, Diego Fernando Valencia |
Sometidas
Año | Título invención | Autores |
2020 |
Nanosensor de efecto de campo para la detección de metabolitos simples en organismos vivos |
Andrés Jaramillo y Juan Manuel Marmolejo |
2020 | Phenoagro: sistema y método para el fenotipado de plantas mediante IoT |
María Camila Rebolledo, Juan Andrés Cardoso, Andrés Jaramillo, Hernán Dario Benitez, Luis Eduardo Tobón |
Formación
Estudiantes de doctorado
Estudiantes de maestría
Estudiantes de pregrado
Año/período | Nombre del curso/semillero/trabajo de grado | Institución | No. de estudiantes |
Proyecto |
2020 | Trabajo de grado: Caracterización de la respuesta a una alta concentración de aluminio de sesenta y un (61) líneas genéticas avanzadas de la especie Oryza sativa L, por Laura Andrea González |
Icesi | 1 | P6 |
2020 | Trabajo de grado: Caracterización morfológica y arquitectural del sistema radicular en líneas genéticas avanzadas de arroz (Oryza sativa L.), candidatas para programas de mejoramiento genético, por Lina Marcela Leizano |
Icesi | 1 | P6 |
2020 | Trabajo de grado: Análisis del impacto de la toxicidad por aluminio Al+3 en los suelos ácidos de la Orinoquía y estrategias para mejorar la producción agrícola bajo estas condiciones, por Daniela Vanessa Castaño |
Icesi | 1 | P6 |
2020 | Trabajo de grado: Identificación in silico de variantes en la secuencia del gen homólogo a GCR1 en arroz que codifica para GPCR a partir del análisis de su secuencia en genotipos de arroz, por Maria Alejandra Bahamón |
Icesi | 1 | P6 |
2020 | Trabajo de grado: Design and characterization of a graphene nanosensor for the detection of Ammonia (NH3), por Claudia Ramírez |
PUJC | 1 | P2 |
2020 | Trabajo de grado: Fabricación electroquímica de un sensor de bismuto para la determinación de aluminio, por María Camila Ayala |
USACA | 1 | P2 |
2020 | Trabajo de grado: Control de altura basado en información visual y láser para monitoreo de cultivos agrícolas mediante un UAV, por Wilson Andrés Benavides Castro y Juan Camilo Tolosa Medina |
PUJB | 2 | P4 |
2020 | Trabajo de grado: Mediciones de REO con FA en arroz y nanopartícula de TiO2, por Felipe Casas |
Uniquindío | 1 | P4 |
2020 | Trabajo de grado: Caracterización de un canal inalámbrico en un cultivo de arroz, por Juan Zambrano |
PUJC | 1 | P4 |
2020 | Trabajo de grado: Sistema de monitoreo fenotípico de Arabidopsis Thaliana,activación de la fotosíntesis y ciclos foto morfogénicos en espacios sin luz natural, por Julián Llamo |
PUJC | 1 | P4 |
2020 | Trabajo de grado: Técnicas de aprendizaje de máquina aplicadas en estimación de niveles de nitrógeno en cultivos de arroz, por Juan Sebastián Caldas y Natalia Cera |
PUJB | 2 | P4 |
2020 | Trabajo de grado: Optimización de trayectorias para un UAV en agricultura de precisión, por Christian Santiago Muñoz y Juan Sebastián Corredor |
PUJB | 2 | P4 |
2020 | Trabajo de grado: Evaluación de la tasa de crecimiento y actividad fotosintética de variedades de arroz (Oryza Sativa) con alto potencial de rendimiento y adaptabilidad, por Andrés Felipe Arango |
Uniquindío | 1 | P4 |
2020 | Trabajo de grado: Análisis de la respuesta fotoluminiscente de diferentes clases comerciales de arroz, por Juan Felipe Franco Escobar |
Uniquindío | 1 | P4 |
2020 | Trabajo de grado: In-silico design of a graphene nanoribbon field effect transitor (GNRFET) sensor for the detection of starch, por Isabella López Cifuentes |
PJUC | 1 | P2 |
2019-02 | Trabajo de grado: Estimación de estrés hídrico en cultivos de arroz a partir del procesamiento de imágenes térmicas, por Daniel Panche |
PUJB | 1 | P4 |
2019-02 | Trabajo de grado: Segmentación del dosel arboreo en cultivos de arroz a partir de procesamiento de imágenes, por David Felipe Cuellar |
PUJB | 1 | P4 |
2018-02 | Trabajo de grado: Técnicas de aprendizaje de máquina aplicadas en estimación de niveles de nitrógeno en cultivos de arroz, por Juan Sebastián Caldas y Natalia Cera Bornacelli |
PUJB | 2 | P4 |
Posdoctorado
Vinculación de recurso humano
Estudiantes de pregrado
Año/período | Nombre del curso/semillero/trabajo de grado | Institución | No. de estudiantes |
Proyecto |
2020-01 | Semillero de investigación Fisicoquímica Teórica | Icesi | 9 | P6 |
2020-01 | Semillero de Investigación en fisiología vegetal y ómicas aplicadas al mejoramiento vegetal |
Icesi | 7 | P6 |
2020-01 | Taller La interdisciplinariedad Principio necesario para la investigación y el desarrollo de Colombia |
PUJC | 46 | P4 |
2020-01 | Taller Trascendiendo Fronteras Disciplinares, | PUJC | 46 | P2 |
2020-01 | Taller ciencia computacional | PUJC | 24 | P2 |
2019 | Joven investigador: Mariana Botero - Trabajo: NPs de Ag para atacar el mal de Panamá |
Uniquindío | 1 | P4 |
2019 | Joven investigador: Daniel Iván Rey - Trabajo: Implementación de sistema portátil para medición de REO con FA con Raspberry |
Uniquindío | 1 | P4 |
2019-02 | Semillero de investigación en fisiología vegetal y ómicas aplicadas al mejoramiento vegetal |
Icesi | 10 | P3 |
2019-01 | Semillero de investigación en exobiología y tópicos en ciencias planetarias |
Icesi | 8 | P3 |
2019-01 | Semillero de Investigación en fisiología vegetal y ómicas aplicadas al mejoramiento vegetal |
Icesi | 10 | P3 |
2019-01 | Curso en Bioinformática | PUJC | 15 | P1 |
2018-02 | Semillero de Investigación en fisiología vegetal y ómicas aplicadas al mejoramiento vegetal |
8 | P3 | |
2018-02 | Semillero en exobiología y tópicos en ciencias planetarias | Icesi | 8 | P3 |
Estudiantes de maestría
Año/período | Nombre del curso/semillero/trabajo de grado | Institución | Proyecto |
2020 | Héctor Enrique Heredia | PUJB | P4 |
2020 | Claudia Ocampo | Icesi | P3 |
2019 | Curso Mapeo Genético - 7 estudiantes | Icesi | P6 |
2019 | Curso Sistema CRISPR - 17 estudiantes | Icesi | P6 |
Estudiantes de doctorado
Desarrollo tecnológico
Productos empresariales
En desarrollo
Nombre | Investigadores | Proyecto |
Planta piloto: Laboratorio de computación de alto rendimiento |
Mauricio Quimbaya | P1 |
Planta piloto: Laboratorio húmedo para extracción de ácidos nucleicos de tejidos vegetales |
Mauricio Quimbaya | P1 |
Planta piloto: Laboratorio de dispositivos nano/micro-fluídicos | Andrés Jaramillo | P2 |
Planta piloto: Infraestructura para mejoramiento in silico de variedades |
Jorge Finke | P5 |
Planta piloto: Fenómica de cultivo | Julián Colorado | P4 |
En pruebas preliminares
Nombre | Investigadores | Proyecto |
Equipo para la síntesis por reducción de electrodos de grafeno |
Andrés Jaramillo, Sammy Perdomo y Juan Manuel Marmolejo |
P2 |
Potenciostato portable | Andrés Jaramillo y Sammy Perdomo | P2 |
Plataforma de fenotipado móvil | Julián Colorado | P4 |
Productos tecnológicos
Nombre | Investigadores | Proyecto |
Software: Archivos de estructuras de GCR1 minimizada y embebida en la membrana más solvente |
Carlos Arango y Andrés Jaramillo | P3 |