Software

Software Node Classification: Este paquete tiene como objetivo proporcionar diferentes soluciones al problema de clasificación de nodos (conocido como predicción de atributos) utilizando técnicas de aprendizaje automático. Las soluciones o enfoques disponibles son: clasificación independiente (o plana) (FNC) y clasificación jerárquica (HC). Ambas soluciones se basan en un algoritmo de optimización de gradiente llamado XGBOOST, además se usan técnicas de sobremuestreo (SMOTE), validación cruzada y optimización de parámetros.

Authors: Rocha C; Romero M; Finke J. 

Software workflow for condition specific co-expression network analysis: El objetivo de la etapa de pre-procesamiento de datos es construir las  matrices  respectivamente,  los  cambios en  los  valores  fenotípicos  y  los  niveles  de  expresión  entre  el  control  y   la   condición   de   tratamiento.  Se utiliza para corregir el tamaño de la biblioteca y el sesgo  de  composición  de  ARN.  los datos normalizados son   representados   como   una   matriz, y  las réplicas biológicas  de   cada  los genotipos se promedian y se representan como una matriz.

Authors: Rocha C; Riccio C; Finke J. 

Software Lock-in Digital usando Raspberry PI3 B+: Es un instrumento virtual desarrollado en un lenguaje de programación Python, se encuentra instalado en una Raspberry PI3 B+, con este software se manipula un conjunto de dispositivos electrónicos para la instrumentación de un sistema que procesa señales fotoacústicas, con el cual es posible hacer estudios de la actividad fotosintética en plantas, este software a través de sus funciones, permite generar varias alternativas de uso y aplicación como los amplificadores lock-in digitales.

Authors: Gordillo F; Cepeda D; García J.