Autores: Miguel Romero, Felipe Kenji Nakano, Jorge Finke, Camilo Rocha y CelineVens
Leveraging class hierarchy for detecting missing annotations on hierarchical multi-label classification

Autores: Miguel Romero, Felipe Kenji Nakano, Jorge Finke, Camilo Rocha y Celine Vens.

Con el desarrollo de nuevas tecnologías de secuenciación, la disponibilidad de datos genómicos ha crecido exponencialmente. Durante la última década, numerosos estudios han utilizado datos genómicos para identificar asociaciones entre genes y funciones biológicas. Si bien estos estudios han demostrado éxito en la anotación de genes con funciones, a menudo asumen que los genes están completamente anotados y no tienen en cuenta que los conjuntos de datos son escasos y ruidosos. Este trabajo propone un método para detectar anotaciones faltantes en el contexto de la clasificación jerárquica de etiquetas múltiples. Más precisamente, nuestro método explota las relaciones de funciones, representadas como una jerarquía, calculando probabilidades basadas en los caminos de las funciones en la jerarquía. Al realizar varios experimentos en una variedad de arroz (Oriza sativa Japonica), mostramos que el método propuesto detecta con precisión las anotaciones que faltan y produce resultados superiores en comparación con los métodos más avanzados de la literatura.

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